昭和39年	2月	長崎進により 長崎胃腸科外科医院 開設 防府消化器病センターの原点は、長崎進先生の長崎胃腸科外科医院の開業に始まります。 昭和39年2月1日に防府天満宮参道脇の旭町の旧家を借り、一人で外科手術を含めた胃腸疾患の診療を開始しました。 その後、南園義一先生、戸田智博先生とともに、現在の地で三者共同経営という形態をとりながら、当センターの礎を作り上げました。
昭和41年	12月	長崎進、南園義一共同経営にて 防府胃腸科医院 開設 許可病床19床 職員数20名
昭和45年	4月	戸田智博共同経営参加
昭和46年	1月	防府胃腸病院 開設 許可病床41床 職員数47名
昭和54年	4月	財団法人 防府消化器病センター 設立 理事長:長崎進、常務理事:南園義一、戸田智博
昭和56年	4月	病院新築 許可病床150床 職員数111名 簡易オーダリングシステム導入(NEC ACOS250/40)
昭和57年	4月	許可病床180床
昭和62年	5月 12月	救急医療機関 指定 日本消化器内視鏡学会認定指導施設
昭和63年	1月 10月	日本消化器外科学会専門医修練施設 日本消化器病学会認定施設
平成元年	12月	オーダーリングシステム稼働(NEC ACOS3300/10)
平成4年	11月	日本大腸肛門病学会専門医修練施設
平成7年	1月	PCオーダリングシステム導入
平成10年	4月 5月 10月	許可病床163床　職員数196名 南園義一　理事長着任 日本消化器集団検診学会認定施設
平成12年	5月	川野豊一 理事長着任
平成14年	4月	許可病床120床 職員数147名
平成15年	7月 10月	新病棟での診療開始 NEC電子カルテシステム・PACS導入 臨床研修病院指定
平成16年	3月	新築2期工事竣工
平成23年	4月 10月	三浦修 理事長着任 施設基準 一般病棟入院基本料 7対1算定開始
平成24年	3月	CT装置更新 TOSHIBA Alexion TSX-032A 16列マルチスライス
平成26年	4月 11月	法改正により 一般財団法人 防府消化器病センターへ 遠隔画像診断開始 山口医療画像研究センター
平成28年	4月	DPC準備病院
平成30年	4月 8月 12月	DPC病院 食道内科、リハビリテーション科 新設 入退院在宅療養支援室設置 一般病床60床を地域包括ケア病棟へ転換
平成31年	1月	肛門外科 新設
令和元年	6月 12月	マンモグラフィ装置 Peruru DIGITAL(MGU-1000D)設置 医療情報システム 県央デルタネット運用開始
令和2年	4月	AI問診 導入 山口県新型コロナウイルス感染症入院協力医療機関Iに指定
令和3年	4月 8月	広島大学病院寄附講座 「防府消化器病センター内視鏡外科講座」開設 麻酔科 新設
令和4年	3月	CT撮影装置、X線TV装置 更新
令和5年	4月	許可病床108床 患者サポートセンター 開設
令和6年	2月	日本医療評価機構・病院機能評価認定取得 （一般病院１　3rdG：Ver.3.0）